Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC1Q15751 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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