Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMGN3Q15651 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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