Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRADDQ15628 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRADDQ15628 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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