Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A2Q15428 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A2Q15428 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3A2Q15428 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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