Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF4Q15080 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF4Q15080 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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