Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD3Q15059 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRD3Q15059 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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