Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KARSQ15046 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KARSQ15046 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KARSQ15046 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KARSQ15046 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KARSQ15046 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KARSQ15046 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KARSQ15046 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KARSQ15046 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KARSQ15046 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KARSQ15046 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KARSQ15046 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KARSQ15046 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KARSQ15046 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KARSQ15046 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KARSQ15046 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KARSQ15046 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KARSQ15046 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KARSQ15046 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KARSQ15046 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KARSQ15046 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KARSQ15046 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KARSQ15046 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KARSQ15046 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KARSQ15046 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KARSQ15046 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KARSQ15046 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KARSQ15046 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KARSQ15046 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KARSQ15046 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KARSQ15046 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KARSQ15046 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KARSQ15046 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KARSQ15046 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KARSQ15046 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KARSQ15046 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KARSQ15046 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KARSQ15046 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KARSQ15046 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KARSQ15046 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KARSQ15046 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KARSQ15046 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KARSQ15046 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KARSQ15046 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KARSQ15046 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KARSQ15046 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KARSQ15046 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KARSQ15046 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KARSQ15046 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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