Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAM2Q15035 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAM2Q15035 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAM2Q15035 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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