Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHPRHQ149N8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHPRHQ149N8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHPRHQ149N8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
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