Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSPNQ14714 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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