Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS1Q14691 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GINS1Q14691 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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