Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC3Q14574 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC3Q14574 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC3Q14574 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms