Protein–RNA interactions for Protein: Q14151

SAFB2, Scaffold attachment factor B2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFB2Q14151 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.013e-7■■□□□ 13
SAFB2Q14151 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.463e-7■■□□□ 13
SAFB2Q14151 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-7■■□□□ 13
SAFB2Q14151 ZNF280B-202ENST00000619852 3981 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.53e-7■■□□□ 13
SAFB2Q14151 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.213e-7■■□□□ 13
SAFB2Q14151 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 331.07■■■□□ 2.561e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 422.95■■□□□ 1.261e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.241e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)22.35■■□□□ 1.171e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.971e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.831e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)17.77■□□□□ 0.431e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-203ENST00000460522 1703 ntTSL 225.31■■□□□ 1.646e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-208ENST00000477938 1715 ntTSL 224.66■■□□□ 1.546e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.416e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.246e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-211ENST00000483635 2169 ntTSL 320.02■□□□□ 0.86e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-204ENST00000463964 1874 ntTSL 312.25□□□□□ -0.456e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-206ENST00000474379 1662 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.566e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-209ENST00000478794 475 ntTSL 24.17□□□□□ -1.746e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 LYPLAL1-205ENST00000469590 1701 ntTSL 33.84□□□□□ -1.796e-7■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-8■■□□□ 12.9
SAFB2Q14151 PIGG-212ENST00000506898 832 ntTSL 323.25■■□□□ 1.312e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-207ENST00000504187 1784 ntTSL 222.96■■□□□ 1.272e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-211ENST00000506402 2387 ntTSL 1 (best)20.28■□□□□ 0.842e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.282e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-14■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 ARHGAP11B-203ENST00000563110 2043 ntTSL 1 (best)22.73■■□□□ 1.232e-6■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 ARHGAP11B-206ENST00000566548 484 ntTSL 316.72■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 231.61■■■□□ 2.656e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-204ENST00000417582 655 ntTSL 228.87■■■□□ 2.216e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-207ENST00000432704 570 ntTSL 426.14■■□□□ 1.786e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-213ENST00000609040 1652 ntTSL 225.93■■□□□ 1.746e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-208ENST00000444839 565 ntTSL 524.85■■□□□ 1.576e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.036e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.296e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-206ENST00000429242 504 ntTSL 316.24■□□□□ 0.196e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.016e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 GATAD2A-205ENST00000418032 3480 ntTSL 213.88□□□□□ -0.196e-7■■□□□ 12.8
SAFB2Q14151 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 228.83■■■□□ 2.212e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 427.65■■■□□ 2.022e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-204ENST00000474374 1161 ntTSL 520.94■□□□□ 0.942e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.732e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.722e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-208ENST00000638376 1096 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-205ENST00000638184 1330 ntTSL 517.16■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-214ENST00000638917 2306 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-207ENST00000638347 1651 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-211ENST00000638508 2163 ntTSL 516.67■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-221ENST00000640081 2385 ntTSL 515.9■□□□□ 0.142e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-215ENST00000638984 1330 ntTSL 514.14□□□□□ -0.152e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-226ENST00000640790 1249 ntTSL 513.34□□□□□ -0.272e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-210ENST00000638482 3084 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-227ENST00000640921 2721 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.941e-6■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 411.38□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.72□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.54■■■□□ 21e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.061e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.921e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.311e-7■■□□□ 12.7
SAFB2Q14151 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 523.55■■□□□ 1.362e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 JPX-209ENST00000602920 625 ntTSL 213.36□□□□□ -0.272e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 311.67□□□□□ -0.542e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 JPX-204ENST00000602294 502 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.992e-10■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.572e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 35.66□□□□□ -1.52e-6■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 23.86□□□□□ -1.792e-6■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 22.43□□□□□ -2.022e-6■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.222e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.962e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 26.84□□□□□ -1.312e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.482e-7■■□□□ 12.6
SAFB2Q14151 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 56.22□□□□□ -1.411e-6■■□□□ 12.6
Retrieved 100 of 3,296 protein–RNA pairs in 92.5 ms