Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A3Q14050 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A3Q14050 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL9A3Q14050 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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