Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP5Q14008 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP5Q14008 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP5Q14008 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms