Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRF5Q13568 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRF5Q13568 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
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