Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF4BQ13523 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF4BQ13523 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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