Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BFSP2Q13515 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BFSP2Q13515 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms