Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC3Q13507 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRPC3Q13507 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRPC3Q13507 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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