Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXE3Q13461 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXE3Q13461 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXE3Q13461 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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