Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B2Q13435 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SF3B2Q13435 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
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