Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XRCC4Q13426 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XRCC4Q13426 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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