Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSLNQ13421 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSLNQ13421 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSLNQ13421 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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