Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME3Q13232 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME3Q13232 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME3Q13232 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME3Q13232 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME3Q13232 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME3Q13232 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME3Q13232 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NME3Q13232 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME3Q13232 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME3Q13232 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME3Q13232 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME3Q13232 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME3Q13232 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NME3Q13232 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME3Q13232 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NME3Q13232 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME3Q13232 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME3Q13232 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME3Q13232 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME3Q13232 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME3Q13232 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME3Q13232 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME3Q13232 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NME3Q13232 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME3Q13232 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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