Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX3Q13185 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CBX3Q13185 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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