Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIA1Q13136 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA1Q13136 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA1Q13136 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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