Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF1Q13077 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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TRAF1Q13077 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF1Q13077 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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