Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PRDM2Q13029 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PRDM2Q13029 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRDM2Q13029 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRDM2Q13029 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PRDM2Q13029 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PRDM2Q13029 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PRDM2Q13029 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
PRDM2Q13029 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PRDM2Q13029 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PRDM2Q13029 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM2Q13029 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM2Q13029 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM2Q13029 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM2Q13029 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PRDM2Q13029 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM2Q13029 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM2Q13029 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PRDM2Q13029 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC40.01■■■■■ 4
PRDM2Q13029 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
PRDM2Q13029 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PRDM2Q13029 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
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