Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP1Q12981 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP1Q12981 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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