Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTP4A2Q12974 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTP4A2Q12974 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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