Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC20Q12834 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC20Q12834 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC20Q12834 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms