Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
HMGXB3Q12766 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
HMGXB3Q12766 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.23
HMGXB3Q12766 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
HMGXB3Q12766 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
HMGXB3Q12766 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
HMGXB3Q12766 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
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