Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 HES1YOR237W 1305 nt5.3□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 YGR122WYGR122W 1209 nt5.3□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 PCT1YGR202C 1275 nt5.3□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.3□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 PCL8YPL219W 1479 nt5.3□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 RPN5YDL147W 1338 nt5.29□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 WTM1YOR230W 1314 nt5.29□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 FRE1YLR214W 2061 nt5.29□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 RPS9AYPL081W 594 nt5.29□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 MRL1YPR079W 1146 nt5.29□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 TFC7YOR110W 1308 nt5.28□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 HOT1YMR172W 2160 nt5.28□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 YKR104WYKR104W 921 nt5.28□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 RMI1YPL024W 726 nt5.28□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 SMA1YPL027W 738 nt5.28□□□□□ -1.56
NFI1Q12216 TUB3YML124C 1338 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 SUM1YDR310C 3189 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 SSZ1YHR064C 1617 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YDL114WYDL114W 927 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 ESF1YDR365C 1887 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YGR291CYGR291C 222 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YIL028WYIL028W 399 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 GDE1YPL110C 3672 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YPL113CYPL113C 1191 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.27□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 FMP33YJL161W 543 nt5.26□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 SLT2YHR030C 1455 nt5.26□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 SED4YCR067C 3198 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 TSL1YML100W 3297 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 RRP4YHR069C 1080 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 PML1YLR016C 615 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 snR19snR19 568 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 VHS1YDR247W 1386 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 LPL1YOR059C 1353 nt5.25□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 MNS1YJR131W 1650 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 MMP1YLL061W 1752 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 ARP10YDR106W 855 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 TOM20YGR082W 552 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YIR043CYIR043C 693 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 MOG1YJR074W 657 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 PRP46YPL151C 1356 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 KRS1YDR037W 1776 nt5.24□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 STL1YDR536W 1710 nt5.23□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 SUR2YDR297W 1050 nt5.23□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YLR184WYLR184W 348 nt5.23□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 RPS15YOL040C 429 nt5.23□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 BUL1YMR275C 2931 nt5.23□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 PEX29YDR479C 1665 nt5.22□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 YIL060WYIL060W 435 nt5.22□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 IMD1YAR073W 1212 nt5.22□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 ROT1YMR200W 771 nt5.22□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 AAD15YOL165C 432 nt5.22□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 HRK1YOR267C 2280 nt5.22□□□□□ -1.57
NFI1Q12216 FYV1YDR024W 486 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 HCR1YLR192C 798 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 TIP41YPR040W 1071 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ATG12YBR217W 561 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 STE7YDL159W 1548 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 TIF4632YGL049C 2745 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 SEC12YNR026C 1416 nt5.21□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 IBA57YJR122W 1494 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YHR177WYHR177W 1362 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 IFM1YOL023W 2031 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 PRP28YDR243C 1767 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YHL049CYHL049C 816 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 PAU17YLL025W 375 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ZRT2YLR130C 1269 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 PGA2YNL149C 390 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 RAT1YOR048C 3021 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 RFT1YBL020W 1725 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 SAC1YKL212W 1872 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 GSH2YOL049W 1476 nt5.2□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 FMP48YGR052W 1110 nt5.19□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YKL169CYKL169C 384 nt5.19□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 MRP21YBL090W 534 nt5.19□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YOL035CYOL035C 303 nt5.19□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 IXR1YKL032C 1794 nt5.19□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YMR196WYMR196W 3267 nt5.19□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 MCH4YOL119C 1506 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 MDM34YGL219C 1380 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 SMP1YBR182C 1359 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ORC5YNL261W 1440 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 NQM1YGR043C 1002 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ECM19YLR390W 339 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 ENV7YPL236C 1095 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 CTT1YGR088W 1689 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 MRK1YDL079C 1506 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YBR139WYBR139W 1527 nt5.18□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 LEU1YGL009C 2340 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 YCL065WYCL065W 369 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 RML2YEL050C 1182 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 GAL83YER027C 1254 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 IPI1YHR085W 1005 nt5.17□□□□□ -1.58
NFI1Q12216 PRE3YJL001W 648 nt5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms