Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 GFD1YMR255W 567 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 MRPL22YNL177C 930 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 CKA2YOR061W 1020 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 ISA2YPR067W 558 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 OMS1YDR316W 1416 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 MEC3YLR288C 1425 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 IFM1YOL023W 2031 nt6.06□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 YDL057WYDL057W 987 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 BMT5YIL096C 1011 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 RPL3YOR063W 1164 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 SUE1YPR151C 621 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 FES1YBR101C 873 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 snR3snR3 194 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 CLB1YGR108W 1416 nt6.05□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 MIF2YKL089W 1650 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 UBP9YER098W 2265 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 TNA1YGR260W 1605 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 MOB2YFL034C-B 864 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 YGR022CYGR022C 330 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 GRE3YHR104W 984 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 NVJ1YHR195W 966 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 PSR1YLL010C 1284 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 RBD2YPL246C 789 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 NRG2YBR066C 663 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 HXT7YDR342C 1713 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 HXT6YDR343C 1713 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 YTA12YMR089C 2478 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 SFB3YHR098C 2790 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 CDC19YAL038W 1503 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 SMF2YHR050W 1650 nt6.04□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 ATP1YBL099W 1638 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 LSM6YDR378C 261 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 PHM8YER037W 966 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 TIP20YGL145W 2106 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 YGR176WYGR176W 348 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 SKG1YKR100C 1068 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 DCN1YLR128W 810 nt6.03□□□□□ -1.44
SLX4Q12098 BUL1YMR275C 2931 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YDL183CYDL183C 963 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YDR445CYDR445C 408 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YEL074WYEL074W 339 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 CBP4YGR174C 513 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 PSH1YOL054W 1221 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 TAX4YJL083W 1815 nt6.02□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 DON1YDR273W 1098 nt6.01□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 EDC1YGL222C 528 nt6.01□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YLR124WYLR124W 345 nt6.01□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YPL073CYPL073C 486 nt6.01□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 REX3YLR107W 1215 nt6□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 NHP6BYBR089C-A 300 nt6□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 CLP1YOR250C 1338 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 MID1YNL291C 1647 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YAP1801YHR161C 1914 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 TFG1YGR186W 2208 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 MED2YDL005C 1296 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 MTC2YKL098W 1074 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YKL223WYKL223W 333 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 STL1YDR536W 1710 nt5.99□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 KEX2YNL238W 2445 nt5.98□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YHR177WYHR177W 1362 nt5.98□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 SNZ3YFL059W 897 nt5.98□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 ADD66YKL206C 804 nt5.98□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 SNZ2YNL333W 897 nt5.98□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 NDJ1YOL104C 1059 nt5.98□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 GYP1YOR070C 1914 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 EFM4YIL064W 774 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 PHO86YJL117W 936 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 PRM9YAR031W 897 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 YOL131WYOL131W 327 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 MRPL36YBR122C 534 nt5.97□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 SSK22YCR073C 3996 nt5.96□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 RAD57YDR004W 1383 nt5.96□□□□□ -1.45
SLX4Q12098 LUC7YDL087C 786 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 NTR2YKR022C 969 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 SNO1YMR095C 675 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 ENV9YOR246C 993 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 OAZ1YPL052W 879 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 DEG1YFL001W 1329 nt5.96□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 NOT3YIL038C 2511 nt5.95□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 SHE10YGL228W 1734 nt5.95□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 CAB4YGR277C 918 nt5.95□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 HCR1YLR192C 798 nt5.95□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 RMI1YPL024W 726 nt5.95□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 ADY2YCR010C 852 nt5.94□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 GLE2YER107C 1098 nt5.94□□□□□ -1.46
SLX4Q12098 SUA5YGL169W 1281 nt5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms