Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 RPL12AYEL054C 498 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 YPT32YGL210W 669 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RRT7YLL030C 342 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 LEM3YNL323W 1245 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 HSP26YBR072W 645 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 HOF1YMR032W 2010 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 HPF1YOL155C 2904 nt5.43□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 ATG20YDL113C 1923 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 GAL10YBR019C 2100 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 MPP10YJR002W 1782 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 MTC1YJL123C 1437 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 ATP14YLR295C 375 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SER1YOR184W 1188 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SIP5YMR140W 1470 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RRN3YKL125W 1884 nt5.42□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 PMA1YGL008C 2757 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SIR2YDL042C 1689 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 YDR053WYDR053W 396 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 IPK1YDR315C 846 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 YHR095WYHR095W 495 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 PRS1YKL181W 1284 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 MTF1YMR228W 1026 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 DCC1YCL016C 1143 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 KIP2YPL155C 2121 nt5.41□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 GCS1YDL226C 1059 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 PNP1YLR209C 936 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 RPL21BYPL079W 483 nt5.4□□□□□ -1.54
VPS54Q12071 SIA1YOR137C 1869 nt5.4□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 BRF1YGR246C 1791 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 NQM1YGR043C 1002 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 YGR291CYGR291C 222 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 SCO1YBR037C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 AVT3YKL146W 2079 nt5.39□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 PDC1YLR044C 1692 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 DBF2YGR092W 1719 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 UTR4YEL038W 684 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 PHO86YJL117W 936 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 STE50YCL032W 1041 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 DBF4YDR052C 2115 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 APJ1YNL077W 1587 nt5.38□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 FOL1YNL256W 2475 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 OCA5YHL029C 2040 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 ASP1YDR321W 1146 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 YMD8YML038C 1329 nt5.37□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 YEL077CYEL077C 3834 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 RPA49YNL248C 1248 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 GAS3YMR215W 1575 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 SSZ1YHR064C 1617 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 RAD53YPL153C 2466 nt5.36□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 FRE3YOR381W 2136 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 ARB1YER036C 1833 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 RPS16BYDL083C 432 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 PHM8YER037W 966 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 BUD28YLR062C 378 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 RSA3YLR221C 663 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 YOR024WYOR024W 324 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 CKA2YOR061W 1020 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 CAM1YPL048W 1248 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 snR32snR32 188 nt5.35□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 RPN12YFR052W 825 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 SEH1YGL100W 1050 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 ADD37YMR184W 597 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 NRM1YNR009W 750 nt5.34□□□□□ -1.55
VPS54Q12071 APE1YKL103C 1545 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 NGL2YMR285C 1548 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 RPT2YDL007W 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 RPT4YOR259C 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 HST4YDR191W 1113 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 NAG1YGR031C-A 492 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 YIR043CYIR043C 693 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 TIP41YPR040W 1071 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 NRD1YNL251C 1728 nt5.33□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 KCH1YJR054W 1494 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 BUD14YAR014C 2130 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 SCM3YDL139C 672 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MNN10YDR245W 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 YKR041WYKR041W 753 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 COX11YPL132W 903 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MMR1YLR190W 1476 nt5.32□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 SLD2YKL108W 1362 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 ARN2YHL047C 1863 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 ERD1YDR414C 1089 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 BGL2YGR282C 942 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MDY2YOL111C 639 nt5.31□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 RAM1YDL090C 1296 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MTW1YAL034W-A 870 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 PRE7YBL041W 726 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 CWC25YNL245C 540 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 FRE7YOL152W 1863 nt5.3□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 KTI12YKL110C 942 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MID2YLR332W 1131 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MRL1YPR079W 1146 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 MSH1YHR120W 2880 nt5.29□□□□□ -1.56
VPS54Q12071 EXO1YOR033C 2109 nt5.29□□□□□ -1.56
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