Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 SPL2YHR136C 447 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 PEX22YAL055W 543 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 CWC25YNL245C 540 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 SER33YIL074C 1410 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 MCM6YGL201C 3054 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 PDI1YCL043C 1569 nt5.62□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 ARO2YGL148W 1131 nt5.61□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 DRN1YGR093W 1524 nt5.61□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 XPT1YJR133W 630 nt5.61□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 NOP8YOL144W 1455 nt5.61□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YEL077CYEL077C 3834 nt5.6□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 COT1YOR316C 1320 nt5.6□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 VPS29YHR012W 849 nt5.6□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 COA2YPL189C-A 207 nt5.6□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 NGR1YBR212W 2019 nt5.6□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YNG2YHR090C 849 nt5.59□□□□□ -1.51
DSE3Q08729 YHP1YDR451C 1062 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ORM1YGR038W 669 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 FEX1YOR390W 1128 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 PET20YPL159C 762 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 FEX2YPL279C 1128 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 HAP1YLR256W 4509 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ACC1YNR016C 6702 nt5.58□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 CST6YIL036W 1764 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 HXT4YHR092C 1731 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 PUS1YPL212C 1635 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 THI5YFL058W 1023 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 REV7YIL139C 738 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 MIM2YLR099W-A 264 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 THI12YNL332W 1023 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ODC2YOR222W 924 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 MRI1YPR118W 1236 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ARB1YER036C 1833 nt5.57□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 BNA5YLR231C 1362 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ATG23YLR431C 1362 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 RRP1YDR087C 837 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ARP1YHR129C 1155 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 PDR16YNL231C 1056 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 CUE5YOR042W 1236 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 SLD7YOR060C 774 nt5.56□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 SYG1YIL047C 2709 nt5.55□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 snR78snR78 87 nt5.55□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 YEL074WYEL074W 339 nt5.55□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 TAF4YMR005W 1167 nt5.55□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.55□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 YBR016WYBR016W 387 nt5.55□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 MKK2YPL140C 1521 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 YIR007WYIR007W 2295 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 CUE2YKL090W 1332 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 SNU71YGR013W 1863 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 MMS21YEL019C 804 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 PRS1YKL181W 1284 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 URE2YNL229C 1065 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 ENV9YOR246C 993 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 VTH1YIL173W 4650 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 VTH2YJL222W 4650 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 HSP104YLL026W 2727 nt5.54□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 VAN1YML115C 1608 nt5.53□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 MGR2YPL098C 342 nt5.53□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 PRE2YPR103W 864 nt5.53□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 MLF3YNL074C 1359 nt5.53□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 CTS2YDR371W 1536 nt5.53□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 SEC18YBR080C 2277 nt5.53□□□□□ -1.52
DSE3Q08729 UGA2YBR006W 1494 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 MMT2YPL224C 1455 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 RML2YEL050C 1182 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 GTO1YGR154C 1071 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 SSY5YJL156C 2100 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 SPG4YMR107W 348 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 BRE2YLR015W 1518 nt5.52□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 SIA1YOR137C 1869 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 NSI1YDR026C 1713 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YAP1802YGR241C 1707 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ADE3YGR204W 2841 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 CTR3YLR411W 726 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 MRPL24YMR193W 777 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 MDG1YNL173C 1101 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ETT1YOR051C 1239 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 DSE3YOR264W 1293 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 HST2YPL015C 1074 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ATE1YGL017W 1512 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ABZ1YNR033W 2364 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 ROG3YFR022W 2202 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 DEF1YKL054C 2217 nt5.51□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 NUP116YMR047C 3342 nt5.5□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 CAB4YGR277C 918 nt5.5□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 TAF11YML015C 1041 nt5.5□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.5□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 CTR1YPR124W 1221 nt5.5□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YIL092WYIL092W 1902 nt5.5□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 MCH4YOL119C 1506 nt5.49□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 MET7YOR241W 1647 nt5.49□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 NOP16YER002W 696 nt5.49□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 LSM12YHR121W 564 nt5.49□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 YOR342CYOR342C 960 nt5.49□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 HXT14YNL318C 1623 nt5.48□□□□□ -1.53
DSE3Q08729 BUD14YAR014C 2130 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms