Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD300CQ08708 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD300CQ08708 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms