Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP3CAQ08209 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP3CAQ08209 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP3CAQ08209 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms