Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN3Q08043 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN3Q08043 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms