Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR3Q06889 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR3Q06889 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR3Q06889 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms