Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABPB1Q06547 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPB1Q06547 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms