Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNG1Q06432 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNG1Q06432 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNG1Q06432 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms