Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTK2Q05397 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTK2Q05397 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTK2Q05397 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms