Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACVR1Q04771 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACVR1Q04771 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms