Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN1Q04323 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN1Q04323 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBXN1Q04323 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms