Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	SEC12	YNR026C	1416 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	MCH4	YOL119C	1506 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	MET7	YOR241W	1647 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	HXT3	YDR345C	1704 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	NSG1	YHR133C	876 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	MED4	YOR174W	855 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	CLB2	YPR119W	1476 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	SSK22	YCR073C	3996 nt		6	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	ATM1	YMR301C	2073 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	NOP2	YNL061W	1857 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	MPM1	YJL066C	759 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	CCS1	YMR038C	750 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	NPT1	YOR209C	1290 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	SCO1	YBR037C	888 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.98	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	SRV2	YNL138W	1581 nt		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	SPL2	YHR136C	447 nt		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	RHO2	YNL090W	579 nt		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	GUP2	YPL189W	1830 nt		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	PRM1	YNL279W	1986 nt		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	YEF1	YEL041W	1488 nt		5.96	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	CCZ1	YBR131W	2115 nt		5.96	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	KEX2	YNL238W	2445 nt		5.96	□□□□□ -1.45
SYF1	Q04048	MKK2	YPL140C	1521 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YLF2	YHL014C	1218 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	DCI1	YOR180C	816 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	SCP1	YOR367W	603 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	UBA3	YPR066W	900 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	SMF3	YLR034C	1422 nt		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	CLB4	YLR210W	1383 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	ALD6	YPL061W	1503 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YIR007W	YIR007W	2295 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	UPS3	YDR185C	540 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YDR396W	YDR396W	501 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	ERD1	YDR414C	1089 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	MCM6	YGL201C	3054 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	GEP5	YLR091W	882 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	MRPL39	YML009C	213 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	RFA2	YNL312W	822 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YPR098C	YPR098C	486 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	HFI1	YPL254W	1467 nt		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	PDH1	YPR002W	1551 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	SAF1	YBR280C	1914 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YDL027C	YDL027C	1263 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	GLO2	YDR272W	825 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	HSP31	YDR533C	714 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	MVD1	YNR043W	1191 nt		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	DBP9	YLR276C	1785 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	SFB3	YHR098C	2790 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	HEM3	YDL205C	984 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	NIT2	YJL126W	924 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	FUN19	YAL034C	1242 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	PEP4	YPL154C	1218 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	THP1	YOL072W	1368 nt		5.93	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	SCM3	YDL139C	672 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	PXR1	YGR280C	816 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	RPA49	YNL248C	1248 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	CWC27	YPL064C	906 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	SPC97	YHR172W	2472 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	BRF1	YGR246C	1791 nt		5.92	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YAP1802	YGR241C	1707 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	FAT3	YKL187C	2253 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	CST6	YIL036W	1764 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	ACS2	YLR153C	2052 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YHR095W	YHR095W	495 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	KTI12	YKL110C	942 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YIF1	YNL263C	945 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	TIF5	YPR041W	1218 nt		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	YPS7	YDR349C	1791 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	FOL1	YNL256W	2475 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	AAP1	YHR047C	2571 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	IWR1	YDL115C	1062 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	RRT7	YLL030C	342 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	HOR7	YMR251W-A	180 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	CUE5	YOR042W	1236 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	Q04048	ADE4	YMR300C	1533 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	UBX2	YML013W	1755 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	SLC1	YDL052C	912 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	SCW10	YMR305C	1170 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	STE50	YCL032W	1041 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	ZUO1	YGR285C	1302 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	ROG3	YFR022W	2202 nt		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	RPL12A	YEL054C	498 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.88	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	TAF10	YDR167W	621 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	MTF1	YMR228W	1026 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	YPL191C	YPL191C	1083 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	RPN5	YDL147W	1338 nt		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	Q04048	TNA1	YGR260W	1605 nt		5.87	□□□□□ -1.47

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