Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 CLP1YOR250C 1338 nt6.06□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 ELP2YGR200C 2367 nt6.06□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YNL095CYNL095C 1929 nt6.06□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 LUC7YDL087C 786 nt6.06□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 ARR3YPR201W 1215 nt6.06□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YDR445CYDR445C 408 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YGR022CYGR022C 330 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YKL169CYKL169C 384 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 CSR1YLR380W 1227 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YET2YMR040W 483 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 FES1YBR101C 873 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 UGA1YGR019W 1416 nt6.05□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 PSE1YMR308C 3270 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 MTC5YDR128W 3447 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 QDR3YBR043C 2070 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YER186CYER186C 921 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YGR122WYGR122W 1209 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 MRP17YKL003C 396 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 OAC1YKL120W 975 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 RMI1YPL024W 726 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 BUL1YMR275C 2931 nt6.04□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 SHM1YBR263W 1473 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 DUR1,2YBR208C 5508 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 HXT7YDR342C 1713 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 HXT6YDR343C 1713 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YDL057WYDL057W 987 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YDL183CYDL183C 963 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 EDC1YGL222C 528 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 YGL262WYGL262W 528 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 MTC2YKL098W 1074 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 NCE103YNL036W 666 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 RPL3YOR063W 1164 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 UBA3YPR066W 900 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 SNF3YDL194W 2655 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 FPK1YNR047W 2682 nt6.03□□□□□ -1.44
CEF1Q03654 OMS1YDR316W 1416 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YER010CYER010C 705 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 RPT6YGL048C 1218 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YHR214WYHR214W 612 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YJL215CYJL215C 360 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 ADD66YKL206C 804 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 MSA2YKR077W 1092 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YAR066WYAR066W 612 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YPL073CYPL073C 486 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 DHH1YDL160C 1521 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 IMA1YGR287C 1770 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 UBP9YER098W 2265 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 TIP20YGL145W 2106 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YEH1YLL012W 1722 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 AFT1YGL071W 2073 nt6.02□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SET4YJL105W 1683 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 ATE1YGL017W 1512 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 DCN1YLR128W 810 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 ROT1YMR200W 771 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 CSG2YBR036C 1233 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 VPS70YJR126C 2436 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 VPS36YLR417W 1701 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 CYK3YDL117W 2658 nt6.01□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SAS4YDR181C 1446 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 ATP1YBL099W 1638 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SOG2YOR353C 2376 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YGR066CYGR066C 879 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YLR124WYLR124W 345 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 POS5YPL188W 1245 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SMF2YHR050W 1650 nt6□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 MAL13YGR288W 1422 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 STL1YDR536W 1710 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YFL042CYFL042C 2025 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 GUA1YMR217W 1578 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SPC34YKR037C 888 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 REX3YLR107W 1215 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YNL143CYNL143C 393 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 ATH1YPR026W 3636 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 CLB1YGR108W 1416 nt5.99□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 HER2YMR293C 1395 nt5.98□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 MPC54YOR177C 1395 nt5.98□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SNZ3YFL059W 897 nt5.98□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 EFM4YIL064W 774 nt5.98□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SNZ2YNL333W 897 nt5.98□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 BRL1YHR036W 1416 nt5.98□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 HXT4YHR092C 1731 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 RGT1YKL038W 3513 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YHR177WYHR177W 1362 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 SUM1YDR310C 3189 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 snR57snR57 88 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 UBC1YDR177W 648 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YLR346CYLR346C 306 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 NRG2YBR066C 663 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 PKC1YBL105C 3456 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 STE20YHL007C 2820 nt5.97□□□□□ -1.45
CEF1Q03654 MKK2YPL140C 1521 nt5.96□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YGL185CYGL185C 1140 nt5.96□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YAP1801YHR161C 1914 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YFL034WYFL034W 3222 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 SEC39YLR440C 2130 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 EXO1YOR033C 2109 nt5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.9 ms