Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNT1Q02742 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCNT1Q02742 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCNT1Q02742 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms