Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLH1Q02575 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NHLH1Q02575 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms