Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1DQ01668 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA1DQ01668 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms